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Schlick, T. Molecular Modeling and Simulation: An Interdisciplinary
Guide. New York, NY: Springer, 2002. ISBN: 038795404X.
Allen, M. P., and D. J. Tildesley. Computer Simulation of Liquids.
New York, NY: Oxford University Press, 1989. ISBN: 0198556454.
Trefethen, L. N., and D. Bau, III. Numerical Linear Algebra.
Philadelphia, PA: SIAM, 1997. ISBN: 0898713617.
Branden, C.-I., and J. Tooze. Introduction to Protein Structure. 2nd
ed. New York, NY: Garland, 1999. ISBN: 0815323050.
Bertero, M., and P. Boccacci. Introduction to Inverse Problems in
Imaging. Philadelphia, PA: Institute of Physics Publishing, 1998. ISBN:
0750304391.
评分标准
评分标准.
| 活动 |
百分比 |
| 家庭作业 |
80% |
| 课堂参与情况 |
20% |
教学日程
教学安排
| 讲座 # |
主题 |
关键日期 |
| Protein Modeling |
| 1 |
简介与蛋白质模型问题 |
|
| 2 |
蛋白质模型 |
|
| 3 |
离散构象搜索 |
|
| 4 |
结合与对接 |
|
| 5 |
分子动态仿真 |
作业1 |
| 6 |
分子动力学与静电学 |
|
| 7 |
连续静电学模型I |
|
| 8 |
连续静电学模型II |
|
| 9 |
静电优化与设计 |
作业2 |
| 10 |
静电学模型 |
|
| 11 |
统计力学 |
|
| 网络模型 |
| 12 |
统计力学 (续) |
|
| 13 |
生物网络的表示与仿真 |
作业3 |
| 14 |
模型表示 |
|
| 15 |
非线性动力学与稳定性 |
作业4 |
| 16 |
稳态问题 |
|
| 17 |
参数拟合与估计 |
|
| 18 |
参数估计：鲁棒性、脆弱性、控制 |
作业5 |
| 图像模型 |
| 19 |
2D与D显微镜；图像重构 |
|
| 20 |
反卷积 |
|
| 21 |
反卷积 II |
|
| 22 |
盲反卷积 |
作业6 |
| 23 |
光流 |
|
| 24 |
高通量数据及分析 |
|
| 25 |
推理和统计 |
|
| 26 |
综述 |
作业7 |