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文献查询
当你想从主要文献库中查找所需论文时,你会发现国家生物信息中心 (NCBI) 这个网址很有用。这个站点拥有在线文献搜索资源 PubMed ,通过PubMed上找到的题目和摘要的大多数还能链接到其电子版本(PDF形式或者是以全文形式)相连接。
另一种在线文献检索工具是 科学数据库网站。它和PubMe在很多方面都很相似,除了它不像PubMed那样主要集中在与医学相关的期刊,而且还包括一些PubMed没有索引的期刊。
科学数据库网站还可以搜索科学引文索引,它可以帮你解决这个问题:“最近有什么论文引用了我已经有的文章?”在研究领域,这种搜索对你了解最新资料是很有用的。
DNA序列分析
序列分析可以利用在NCBI网站上得到的基因库搜索工具来进行研究。这当中最有用的可能就是 Entrez 浏览器,它可以根据关键词搜寻到DNA序列。
如果你有一个DNA序列,并且想知道是否有已知序列和它有同源关系,那么你可以利用 BLAST 工具 (BLASTn)。使用这个工具,你可以把你的序列粘贴进一个窗口,NCBI服务器就会将它与所有的已知序列相比对,在相匹配的地方停止。
另一方面,如果你有两条序列并且想知道他们是否有特殊的匹配关系,可以用 "BLAST 2 序列工具"。
在有些情况下,除了搜索与你自己序列紧密匹配的DNA序列外,你可能更想鉴别那些与你DNA序列翻译出的蛋白质有同源关系的蛋白质。要完成这个任务,可以使用 BLASTx 工具。这个工具可以将你输入的DNA序列翻译成蛋白质,并可以与已有的蛋白质或已有的DNA序列的翻译产物相比对。
在你努力去理解一个细胞内众多的生化途径是如何组合在一起的,或者仅仅是想对一条完整的生理途径有一个大概的了解,通常在网上寻找要比查书本快得多。 京都基因和基因组百科全书 对于给你快速提供代谢方面的知识是非常有用的,它还可以链接到酶、结构和其他有用的信息资源。
如果你对异生素(环境中有毒物质如萘、甲苯、苯、PCBs等等)的生物降解过程特别感兴趣,可以参看 尼苏达大学生物催化/生物降解数据库。
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