在2003年秋季学期中，微生物遗传学实验课程中的各个研究课题主要集中在红球菌中的各种菌类。这个属里的许多细菌能够通过代谢来分解环境中的污染物，或者把它们转化成有用的手性分子。这些细菌还能产生一系列有用的化学物质，包括化工产品（可作为“绿色化学”来进行生产）和一些次生代谢产物，如抗生素。我们鼓励同学们去探索基因是如何对这些细菌的有用性做出贡献的。

总论

本课程由以下三个主要部分组成： 实验室工作、 口头演讲 和 科研论文。因为交流在科研工作中是特别重要的一部分，所以本课程的目标在于着重提高你的写作和口头表达的能力。实验室的研究活动将占据你的很大一部分时间；然而，你还需要在课堂上进行口头演讲并且以符合国际科学杂志出版要求的形式来写作你的科研结果。


实验室工作

在这门课程中，教师将会向大家提出一系列微生物领域的问题，而后，教师和助教们将会和你一起共同分析并制定科研方案以解决这些问题。在本学期中，教师们将一对一指导同学们。帮助每个人设计个人的实验方案、分析试验结果并克服实验技术上的问题。


口头演讲

为了培养和增强交流技巧，本学期中我们要求每个同学在课堂上作至少两次较正规的口头演讲。在演讲过程中，同学们通常可以使用投影仪、幻灯片和/或者其他视觉辅助教具。

演讲一：文献讨论

第一次演讲是以“文献讨论”的形式进行的。在这些演讲中，你将会阅读一些第一手的科研论文，并对这些文章进行总结汇报。教师将帮助你确定与你研究领域相关的3至4篇期刊文章。在演讲中，你要讲解论文在所选材料上的背景资料、研究内容并解释论文中所提出的问题。你要描述论文中提到的一系列实验，并且说明该怎样来分析这些数据。在介绍作者的结论时评述该论文的优缺点。讲这些文献时，你应该用一种“讲故事”的方式来讲述在某个特殊领域最近的研究进展。

演讲二：进展报告

第二个正式的演讲以“进展报告”的形式进行，在报告中你将向你的同学们展示你自己研究活动的大纲。在演讲过程中，你要向你的同学们描述你研究领域的背景，记住并不是所有的同学都熟悉他人的研究内容。然后你要描述你自己的实验过程和当时所能收集到的所有数据，并分析你的结果。我们鼓励你和同学们讨论你在研究过程中所遇到的问题，你也可以提出你对实验下一步工作的一些看法。

在你准备演讲的过程中，你都可以和老师讨论你有关本课程的方方面面的想法。教员们也乐意为你的个人演讲提出建议和反馈信息。


写作要求

几个世纪以来，书面交流已经成为传播科研成果和新知识的基石。不管实验技能有多高，缺乏良好的写作技能对任何一个科学家来说都是严重的障碍。因此，在微生物遗传学实验方案里，同学们要进行许多写作活动，然后以期末论文的形式来描述自己的整个研究。

在准备期末论文的过程中，你将要完成两到三篇的半成型写作作业，每一篇作业都将集中在期末论文中某一部分的格式和内容上。因此，第一篇写作作业可能要求写一篇导论。第二篇可能要求写结果部分或者材料和方法部分。写作教师和其他教学人员会指导你完成这些作业。

期末论文的格式要求与世界各国微生物学家发表他们的研究结果时所采用的格式一样。每篇论文应该包含以下几个方面的内容：

• 一个导论来介绍你研究领域的背景和研究的意义，回顾相关文献，并且要明确地描述所要进行的研究的目标。
• 然后，你得在“结果”部分描述你做的实验和获得的数据。你还需要在“材料和方法”部分中把很多的实验程序上的细节描述清楚，但通常在正式的论文中这个部分都放在“结果”部分前面。
• 然后是一个有（至少希望是）深刻见解的讨论部分。在这个部分中，你要能说明数据的缘由、提出一个模型来解释你的观测，并且将你自己的研究工作与其他更广泛的科研领域的科学家们的工作联系起来。

计分方法

这门课的计分依据以下几个方面的表现来进行。

虽然，在这门课程中同学们是两人一组工作的，但在计分时还是按个人计算。

• 实验室中，你是否明白为什么要进行每个实验以及怎样来进行这些实验？
• 在口头演讲中，你是否对演讲主题及其含意进行了仔细思考？
• 你的期末论文是否不仅反映出你对这个具体课题的理解，而且显示出这个研究是怎样在整体上融于整个科学知识体系的？

研究进展、实验技能、努力程度和实验记录（40％）

期末成绩中的40％将依据你在实验室中的表现。你不一定必须完成布置给你的研究计划，但是，你必需展示出你确实具有基本的能力并且你尽了一切努力去进行研究。不是所有来修这门课的人都具有相同的实验室研究经验。老师们知道这一点，所以鼓励你“充分利用”你自己的技能。老师会将你对获取实验技能以外知识的努力考虑到你这部分的评分中。

而且，你也应该表现出良好的“团队精神”——和你的队友一起推动研究工作进行。每个人都应该肩负起自己的重担。

实验记录本

此外，你必须有一个实验记录本。实验记录本非常重要，因为它对养成良好的实验习惯来说是很关键的。每个实验人员都应该保存有自己的实验记录本，它最终应该包含整个小组收集到的所有资料。这样的话，每一个实验人员都可以独立地分析实验结果。

参阅 实验记录指导和建议 来了解该怎样利用、保留和保存可行的实验记录的一些具体信息。

值得一题的是老师可以在一定程度上帮助你纠正实验中的错误。对所作的实验不能清楚地描述会使纠错很困难。助教将会定期检查你的实验记录的完整性，而且记录必须是记录到最近的。你应该每天将前一天的实验记录补充完整。

依赖于你在研究计划中所取得的进展，将来要做此实验的学生、UROPs、或者研究生有一天可能会接着做你留下的工作，并将你的发现进一步深入下去。再有，将来的研究人员可能会感兴趣想知道你是如何解决某一具体的技术问题的，你是怎样操作某个实验的，或者对某个特定实验你所采用的方案。这时候，我们都需要拿到你的实验记录。为使这些情况成为可能，你应该有计划在学期末将你的记录本（或好的影印本）交给教授。

实验时间和出勤

你应该在每天下午一点到五点的通常的实验时间去上课。

如果你不按时上课，你就会获得比较低的分数。如果有紧急事情或者生病，必须与老师或助教联系。

偶尔你也许在下午五点之后还想留在实验室。五点后助教会在实验室逗留一会让同学们完成当日的实验。但是如果因为你迟到或者在正常工作时间内浪费时间而需要工作很晚，助教是不会乐意这样做的。

有时，你可能想在周末的时候来实验室。要想在其他时间来实验室工作的话，那就要由助教来决定了。助教将会通知你他们什么时候会在实验室。如果没有教学工作人员在的话，你是决不允许在实验室工作的。


实验室会议和口头演讲（20％）

每周一和周五的下午，我们将会以小组会议的形式来开始上课。在实验室会议中，我们将会讨论大家所关心的问题，解释实验方案和策略。你也有机会在此通过进展报告、文献讨论和其他形式的演讲来磨练你的演讲技巧。

在文献讨论里，我们要求你阅读能解决相关问题的原始文献。在这个时段中，我们将讨论论文所提出的重要问题，并且提出新的实验方案来解决这些问题。

在本学期初，你要做与你的具体研究项目相关的文献查询 。这一练习的目的是：

• 确保你能很好的理解实验项目的背景、原理和与之相关的问题。
• 确保你能在进行相关文献查询时获得经验。
• 为了激发你的创造力以实现你的目标，或在每个方案中发现新的或有趣的方法来解决关键问题。
• 在你作为小组成员工作时，给你一个提高演讲技巧的机会。

在全班的实验室会议中，每个小组都会有充足的机会来讨论你们的工作。我们将讨论每组所取得的进展，回答所提出的普遍问题。

口头演讲的分数评定主要依据以下几个方面：你对所讨论题目有着深刻理解的展示、演讲的清楚程度、演讲本身的结构（利用视觉教具、演讲风格等等）。


期末论文（25％） 

你必须在期末时递交一份论文，主要描述本门课实验所取得得进展和结果。

这篇论文应该显示出你在本学期中对你的研究课题的理解已达到相当的水平，而且文章应该以实验数据为基础。它不需要对整个学期内所作的或者试着做的所有事情进行详尽的描述。

好的论文常常仅对一学期中的两到三个主要实验进行讨论。在“写作要求”里可以看到更多的信息。论文必须按时在学期的第64次课上交来，没有按时交的论文将会被扣分。

期末论文的分数评定主要依据以下几个方面：你对讨论的主题的深刻理解的展示、论文的清楚程度和论文本身的结构（图形使用、写作方式及参考文献等）。