概述
自从进化的初期，生物就必须要保护它们自身不受病原体侵袭。区分自己和异己的机制就是逐渐进化来完成这个任务的，这个过程开创了宿主和病原体共进化的漫长历史。免疫防御机制的进化导致了多种免疫方式的出现。原核生物使用限制性内切核酸酶、抗微生物肽和RNA干预的方法来进行自我保护。在多细胞生物中，特化的免疫细胞已经进化完成，它们既能够完成对外来细胞的吞噬作用，也可以完成对自身受感染或癌变细胞的吞噬作用。在种系编码受体基础上进化来的防御系统构成了固有免疫系统。在颌类脊椎动物中，有另一个被称为适应性免疫系统的系统可以补充固有免疫系统来发挥作用，适应性免疫系统涉及到由免疫细胞和免疫器官组成的特化的网络。适应性免疫系统与固有免疫系统相反，是建立在免疫受体的多样性和个体内免疫记忆基础上的。在这门课中，我们将分析导致固有免疫系统和适应性免疫系统发展的进化方法，找寻从细菌到高等脊椎动物免疫反应中的共同和特有的特征，并且确定影响因素，例如病原体中影响免疫系统进化的适应性改变。
目标
这门课每周以讨论会的形式，主要是讲免疫系统的基础文献。你将学到有关免疫系统防御机制的进化方面的知识。另外，你还将学会用钻研的眼光去阅读讨论科学文献、论文，评估数据和方法学。
要求
所有13节课的参与都是必须的。如果有急事你就将错过一次课，请告诉我们，这样我们就可以给你安排一个合适的补习作业（例如，写一篇关于那节课的两篇论文的总结）
在大多数课上要讨论两篇论文。提前阅读这些论文是非常重要的。准备讨论时，你要对每一篇文章提出一个讨论问题。鼓励大家积极参与讨论。每节课结束时，我们将提供下节课论文理解的一些背景信息。
有两个额外作业，一个是手写的，一个既有手写的又有口头部分（见下文）
作业
项目 1
你将领到一份没有题目和摘要的科学文献，你的任务是要写一份摘要（不超过250字）和题目
项目 2
学期结束时，你要写一份3页的关于这学期讨论的一个话题的研究方案（双面，12号字）。方案要包括背景概述，可检验的假设和一组检测假设的试验（写出关键步骤）。你要在最后一节课的时候交上你的方案。
成绩
这门课成绩分为过和不过。