该部分的.m文件需要MATLAB® 软件 来运行，.pdb文件需要使用RasMol 软件 来浏览， 任一生物序列比较软件均可导入FASTA格式的序列文件（.fa），使用 Python Interpreter 软件可运行.py文件。
| 家庭作业 1 (PDF) |
prob2seqs.fa (FA)
prob3inputseqs.fa (FA)
prob4seq.txt (TXT)
Sample run for problem 6 (TXT) |
| 家庭作业 2 (PDF) |
dino1.fa (FA)
dino2.fa (FA)
pombe.fa (FA)
motifs.txt (TXT)
random.fa (FA)
5primesplicesites.txt (TXT)
3primesplicesites.txt (TXT)
splicing.run (TXT)
motif.run (TXT) |
| 家庭作业 3 (PDF) |
1fxd.pdb (PDB)
rmsd.py (PY) |
| 家庭作业 4 (PDF) |
hw4.m (M)
repressilator.m (M)
Repressilator model based on: Elowitz M. B., and S. Leibler "A synthetic oscillatory network of transcriptional regulators." Nature 403, no. 6767 (20 Jan 2000): 335-8.
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