MIT OpenCourseWare
OCW Home Course List About OCW Help with OCW Feedback


Search
» 高级搜索
 课程主页
 教学大纲
 教学日程
 参考读物
 讲义
 作业
 考试
 工具
 学习资料

7.91J / 7.36J / BE.490J 计算生物学和系统生物学基础, 2004 春季

Gibbs Sampler - Strong Motif example.
Gibbs Sampler - Strong Motif example. (图片由 Chris Burge. 教授提供)

课程特点

MIT开放课程——计算生物学和系统生物学基础 (CSBi) 是一项校园研究及教育项目,它在综合学科研究法用于复杂生物学现象的系统分析与建模中将生物学、工程学和计算机科学联系在了一起。该课程属于CSB项目中的核心课程之一,它可为对交叉学科以及计算生物学和系统生物学感兴趣的同学提供帮助。

该课程站点包含丰富的生物信息学工具(相关在线资源的链接在 工具 部分)及全套 讲义

课程简介

作为计算生物学的入门教材,该课程着重讲述核酸和蛋白质序列分析、结构分析以及复杂生物学系统分析的基本原理,涵盖了序列比对、模体识别、结构建模、结构预测及网络模型的方法和原理,应使学生了解在计算生物学与系统生物学领域的一些新兴研究体系。


技术要求

本课程站点提供的.m文件需要MATLAB® 软件 支持。 .pdb文件需要RasMol software 或者其他的分子图形软件(如DeepView、PyMol)支持,任一生物序列比较软件均可导入FASTA格式的序列文件(.fa), 软件 Python Interpreter 可运行.py文件,多媒体播放软件,如 QuickTime® PlayerRealOne™ Player, 或者 Windows Media® Player, 可用来播放.avi文件。

师资
授课教师:
Christopher Burge 教授
Amy Keating 教授
Michael Yaffe 教授
 Peter Woolf 博士
课程安排
讲座:
2节/星期
1.5小时/节

答疑:
2节/星期
1小时/节

课程级别
本科生 / 研究生
翻译
李梦龙 博士 教授 分析化学
文志宁 博士 讲师 化学生物学
冯毅 学士 硕士生 生物信息学
方亚平 学士 硕士生 生物信息学

四川大学化学学院
审校
杨毅 博士 教授 分子遗传学
肖丹 博士 教授 分析化学

四川大学化学学院
反馈意见
请把您关于OCW或本课的反馈意见发给我们

 
MIT Home
Massachusetts Institute of Technology Terms of Use Privacy